Hjem-kunnskap-

Innhold

Biotin nærhetsmerkingsteknologi for å konstruere interaksjonskart for humane celleproteiner

Jul 15, 2021

Avdeling er en av egenskapene til eukaryote celler, og forskjellige biokjemiske prosesser kan deles etter romlig struktur. Mikroskopi og massespektrometri-analyse kan brukes til å analysere proteomet til forskjellige organeller, men det er fortsatt vanskelig å bruke disse to metodene direkte til å identifisere interaktomikk i mange intracellulære rom.


For å identifisere interaksjoner i forskjellige rom i humane celler, utga Anne-Claude Gingras forskningsgruppe fra Lunenfeld-Tanenbaum Institute i Canada 2. juni 2021 en artikkel med tittelen A nærhetsavhengig biotinyleringskart over en menneskelig celle, A map av humane celler ble etablert ved hjelp av biotinylering av tilstøtende markører.

Debiotin-avhengig nærhetsmerking metode kan brukes til å beskrive det intracellulære miljøet okkupert av proteinene i cellen. For eksempel bruker BioID-teknologi biotinligasen BirA * (* betyr mutant), som inneholder en R118G-setemutasjon, som kan brukes som et" agn" å smelte sammen med målproteinet og uttrykkes i dyrkede celler eller i et flercellet system. i. Det biotinylerte proteinet kan deretter fanges opp av streptavidin, og det samvirkende proteinet kan analyseres ved massespektrometriidentifikasjon. Siden den gjennomsnittlige diameteren på det globulære proteinet er 5-10 nm, kan merkingsradiusen til denne teknologien direkte biotin merke det interagerende proteinet. For tiden er BioID-teknologi vellykket brukt for å definere sammensetningen av mange forskjellige proteinkomplekser, identifisering av membranbinding og romlig organisering av membranløse organeller.

For ytterligere å identifisere det samvirkende proteomet i humane levende celler, brukte forfatterne BioID-teknologi til å merke 234 intracellulære proteiner i 32 forskjellige cellekomponenter som" agn" å fange samspillende proteiner for å etablere strukturen til proteinorganisasjon i levende menneskelige celler. Hvert agneprotein vil bli merket med BirA *, og deretter vil en stabil ekspressjonslinje med HEK-celler bli etablert. Ved å sammenligne de identifiserte samspillende proteinene med den negative kontrollen, vurderte forfatterne påliteligheten av de interaksjonsfaktorene som ble fanget. Totalt 192 kandidatproteinmarkører besto kvalitetsvurderingen, og totalt 35 902 interaksjoner ble identifisert. Handlingsfaktor.

Hvis du vil ha en stor rabatt eller en gratis prøve, er du velkommen til å kontakte:liu@wellgreenxa.comTakk. Vi har nok lager til å sende.

Sende bookingforespørsel

Sende bookingforespørsel